Zanzibar tem um clima tropical com duas (ou mesmo quatro) estações distintas - estação seca (um curto e um longo) e chuvosa (um curto e um longo). A curta estação seca (quente e úmida) ocorre em janeiro e fevereiro. É a estação mais popular entre os viajantes, porque é considerada "verão" com temperaturas médias em torno de 29°C e pouca chance de chuva. As praias, particularmente nas costas norte e leste, são superlotadas por turistas que visitam os parques e reservas da Tanzânia para safaris selvagens. O segundo período seco chamado "longo" ou "cool" dura cinco meses — de junho a outubro. Este período tem baixos níveis de pluviosidade e temperaturas médias em torno de 25°C. Esta estação é menos lotada do que a curta, embora o tempo seja bonito e o sol esteja por cerca de 7-8 horas por dia.
